Los magnetómetros son instrumentos científicos usados para medir la fuerza de tres de las componentes del campo magnético terrestre. El hardware usado se basa en el uso de un sensor flux gate de 3 ejes.
La red de magnetómetros que opera en IGP se encuentran dentro y fuera del territorio peruano cuyas estaciones ubicadas en las ciudades de Piura, Puerto Maldonado, Radio Observatorio de Jicamarca (Lima), Huancayo, Arequipa, Ica Leticia (Colombia), San Juan (Argentina), Tucumán (Argentina), Alta Floresta (Brasil), entre otras.